Druga faza predstavlja biološki reaktor, kamor priteče že delno očiščena odpadna voda. Z uporabo difuzorjev in puhala, ki vpihujeta zrak, spodbudimo razvoj aerobnih bakterij, ki poskrbijo za razgradnjo organskih snovi in nitrifikacijo amonijaka.
Reaktor je opremljen tudi z nosilci biofilma, imenovanimi Oxybee®, ki so nameščeni v vrečah potopljenih v vodi. Oxybee® nosilci zagotavljajo obsežno površino in prostor za razvoj bakterij (specifična površina je 200m²/m³). Bakterije se bodo hitro razmnožile in ustvarile tanek sloj, znan kot biofilm. Nosilci biofilma so izdelani iz recikliranega PP in PE (polietilen/polipropilen).